スマートフォンでFIDO認証はできますか?

はい。
FIDO2及び、FIDO U2F認証をご利用の場合は、iOS16/ iPadOS16以降はsafariで利用可能、Android7.0以降でかつW3C対応ブラウザ(Chromeもしくは、標準ブラウザ)で利用可能です。ただし、AndroidではOSでサポートされていない場合は利用できない場合があります。

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